根是作物的生命來源，植物通過根系從土壤中攝取養分、水分、有機質供莖、葉、果實生長。從一定程度上來看，根系的分布情況會直接反映作物的生長情況。為了進一步研究根系的影響，專家們通常都會利用植物根系圖像分析系統對其進行研究，以判斷當前作物生長狀況，為制定科學施肥方案提供依據。
根系圖像分析系統和傳統儀器測定不同，系統不僅能測量根系的長度、面積、直徑、根尖數、分叉數、根交叉數等基礎信息，甚至還能自動分析出根系的拓撲形態關系、連接關系，和根尖部位的色彩變化，這些詳細的測量數據能為農業生產帶來更好的效果。
比如怎樣加強根系吸水強度、提高根系水分傳導能力為發展可持續農業、解決水資源供需矛盾提供科學依據是當前和未來實現節水農業的基礎。分析植物根系的分布狀況，可明確土壤水分。養分狀況對植物根系水分、養分傳導的影響，掌握植物根系吸收水分、養分特性從而為不同類型的農田、草地林地等選擇較佳的灌水時期和灌水方式、提高植物根系水分利用效率提供依據。
通過植物根系圖像分析系統還能研究深耕深松后的土壤結構對作物根系活性的影響。深耕深松技術能夠加深耕層疏松土壤，增加土壤的孔隙度，促進作物根系生長，形成土壤水庫，增強雨水滲入速度和數量避免產生地面徑流，通氣性強，提高作物根系呼吸作用使根系生長數量多。
