水環境監測的目的，是獲取有關水環境方面的適時資料信息，為水環境模擬、預測、評價、規劃、預警、管理和制定環境政策、標準等提供基礎資料和依據。水環境監測包括如下內容：

(一) 對進入江、河、湖、庫及海洋等地表水體的污染物質及滲透到地下水中的污染物質進行常規性監測，以掌握水環境質量現狀及其發展趨勢。

(二) 對生產過程、生活設施及其他污染源排放的各類廢水進行重點監測，為實現日常監督管理、預防和控制污染提供依據。

(三) 對水環境污染事故進行應急監測，為分析判斷事故原因、危害及采取對策提供依據。

(四) 為國家政府部門制定水環境保護法規、標準和規劃，全面開展水環境管理工作提供數據和資料支撐。

(五) 為開展水環境質量評價、水資源論證評價及進行水環境科學研究提供基礎數據和依據。

(六) 收集本底數據、積累長期監測資料，為研究水環境容量、實施總量控制與目標管理提供依據。