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ChIP-seq(染色質免疫共沉淀測序)

來源:藍景科信河北生物科技有限公司   2025年04月27日 15:30  

技術簡介

染色質免疫沉淀測序(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing,ChIP-seq是一種將染色質免疫共沉淀(ChIP)與二代測序技術(NGS)相結合,用于研究蛋白質與DNA的相互作用的技術。

技術原理

將染色質免疫共沉淀和高通量測序相結合,通過目的蛋白的特異性抗體,將目的蛋白-DNA復合物沉淀下來,從而獲取該目的蛋白結合的DNA。再通過DNA高通量測序,獲得該蛋白在染色體上的分布情況。利用該技術不僅可以檢測轉錄因子在全基因組上的結合位點,還可以研究各種組蛋白修飾在全基因組上的分布情況。

應用領域

1.癌癥研究:

鑒定腫瘤特異性表觀遺傳標記(如SETD2突變導致的H3K36me3缺失),發現潛在治療靶點。

解析癌基因與抑癌基因的調控機制,為個性化治療提供依據。

2.發育生物學:

追蹤胚胎發育過程中組蛋白修飾的動態變化,揭示細胞命運決定的表觀遺傳機制。

研究干細胞分化過程中關鍵轉錄因子(如Oct4、Sox2)的結合模式。

3.神經科學:

探索神經元活動依賴的表觀遺傳調控,如學習記憶相關基因的染色質重塑。

4.農業與微生物學:

解析作物經濟器官(如種子、果實)的表觀遺傳圖譜,助力抗逆育種。

研究微生物中DNA-蛋白質互作,揭示抗生素耐藥性機制。

技術流程

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分析流程

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部分結果示例

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